Datum
| Liga
| Spielpaarung | Ergebniss | Zuschauer | Spielort
| sonstiges
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| 20.12.2008 | 3.Liga | 1.FC Union Berlin - FC Bayern (A) | 0:0 | 5.700 | Friedrich-Ludwig-Jahn-Stadion | |
| 16.12.2008 | 3.Liga | Kickers Emden - FC Bayern (A) | 0:2 | 3.700 | Embdena-Stadion | |
| 12.12.2008 | 3.Liga | Kickers Offenbach - FC Bayern (A) | 2:0 | 6.457 | Bieberer Berg | |
| 06.12.2008 | 3.Liga | FC Bayern (A) - VfB Stuttgart (A) | 1:1 | 650 | Hermann-Gerland Kampfbahn | |
| 03.12.2008 | 3.Liga | Kickers Emden - FC Bayern (A) | abgesagt | ca. 2.000 | Embdena-Stadion | |
| 30.11.2008 | 3.Liga | SV Austria Burghausen - FC Bayern (A) | 0:0 | 3.300 | Wacker-Arena | |
| 15.11.2008 | 3.Liga | FC Bayern (A) - Rot-Weiß Erfurt | 1:0 | 1.000 | Hermann-Gerland Kampfbahn | |
| 09.11.2008 | 3.Liga | Erzgebirge Aue - FC Bayern (A) | 1:1 | 9.800 | Erzgebirgsstadion |
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| 02.11.2008 | 3.Liga | FC Bayern (A) - Jahn Regensburg | 2:2 | 1.320 | Hermann-Gerland Kampfbahn |
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| 29.10.2008 | 3.Liga | SV Sandhausen - FC Bayern (A) | 3:3 | 2.200 | Hardtwaldstadion | |
| 26.10.2008 | 3.Liga | FC Bayern (A) - SpVgg Unterhaching | 0:0 | 2.250 | Hermann-Gerland Kampfbahn | |
| 18.10.2008 | 3.Liga | Fortuna Düsseldorf - FC Bayern (A) | 1:1 | 13.150 | LTU-Arena |
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| 11.10.2008 | Testspiel | 1.FC Nürnberg - FC Bayern (A) | 1:1 | 372 | Baar-Ebenhausen |
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| 05.10.2008 | 3.Liga | FC Bayern (A) - Stuttgarter Kickers | 3:3 | 950 | Hermann-Gerland Kampfbahn |
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| 27.09.2008 | 3.Liga | SC Paderborn 07 - FC Bayern (A) | 2:1 | 9.431 | Paragon Arena |
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| 19.09.2008 | 3.Liga | FC Bayern (A) - SV Werder Bremen (A) | 1:1 | 1.200 | Hermann-Gerland Kampfbahn |
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| 13.09.2008 | 3.Liga | VfR Aalen - FC Bayern (A) | 0:0 | 3.226 | Waldstadion |
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| 07.09.2008 | Testspiel | FC Bayern (A) - FC Augsburg | 2:2 | 600 | Georg-Weber Stadion (Rain/Lech) |
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| 03.09.2008 | Testspiel | TSV Oberalting/Seefeld - FC Bayern (A) | 1:13 | ca. 800 | Aubachstadion Seefeld |
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| 29.08.2008 | 3.Liga | FC Bayern (A) - FC Carl-Zeiss Jena | 2:1 | 1.700 | Hermann-Gerland Kampfbahn |
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| 23.08.2008 | 3.Liga | Eintracht Braunschweig - FC Bayern (A) | 0:1 | 16.300 | Eintracht-Stadion | |
| 16.08.2008 | 3.Liga | FC Bayern (A) - SG Dynamo Dresden | 1:0 | 7.000 | Hermann-Gerland Kampfbahn |
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02.08.2008 | 3.Liga | Wuppertaler SV - FC Bayern (A) | 2:2 | 6.281 | Stadion am Zoo | |
27.07.2008 | 3. Liga | FC Bayern (A) - 1.FC Union Berlin | 2:1 | 3.300 | Hermann-Gerland Kampfbahn | |
18.07.2008 | Testspiel | TSV Poing - FC Bayern (A) | 1:6 | 450 | Sportplatz Poing |
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16.07.2008 | Testspiel | FC Ingolstadt - FC Bayern (A) | 1:3 | 450 | Steingriff | |
10.07.2008 | Testspiel | FK Pribram (CZ) - FC Bayern (A) | 0:4 | 274 | ASV Miesbach, Am Windfeld |
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07.07.2008 | Testspiel | TSV Grünwald - FC Bayern (A) | 2:1 | 112 | Freizeitpark Grünwald |
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03.07.2008 | Testspiel | SC München - FC Bayern (A) | 0:5 | ? | Bzspa Agilofinger Str |
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31.05.2008 | Regionalliga Süd | FC Bayern (A) - VfR Aalen | 0:1 | 655 | Hermann-Gerland Kampfbahn |
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24.05.2008 | Regionalliga Süd | Wacker Burghausen - FC Bayern (A) | 3:1 | 4.550 | Wacker-Arena | |
18.05.2008 | Regionalliga Süd | FC Bayern (A) - FSV Oggersheim | 7:0 | 650 | Hermann-Gerland Kampfbahn |
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10.05.2008 | Regionalliga Süd | SV Sandhausen - FC Bayern (A) | 3:3 | 4.150 | Hardtwaldstadion | |
06.05.2008 | Regionalliga Süd | FC Bayern (A) - Karlsruher SC (A) | 3:1 | 360 | Hermann-Gerland Kampfbahn |
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02.05.2008 | Regionalliga Süd | KSV Hessen Kassel - FC Bayern (A) | 2:3 | 17.200 | Auestadion | |
25.04.2008 | Regionalliga Süd | FC Bayern (A) - VfB Stuttgart (A) | 1:3 | 500 | Hermann-Gerland Kampfbahn | |
18.04.2008 | Regionalliga Süd | FC Bayern (A) - Sportfreunde Siegen | 3:1 | 585 | Hermann-Gerland Kampfbahn |
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12.04.2008 | Regionalliga Süd | SC Pfullendorf - FC Bayern (A) | 0:0 | 1.080 | Alno-Arena | |
| 05.04.2008 | Regionalliga Süd | FC Bayern (A) - SSV Jahn Regensburg | 3:1 | 730 | Hermann-Gerland Kampfbahn |
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| 29.03.2008 | Regionalliga Süd | FC Ingolstadt 04 - FC Bayern (A) | 1:0 | 5.020 | MTV-Stadion |
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| 20.03.2008 | Regionalliga Süd | FC Bayern (A) - SV Elversberg | 1:1 | 500 | Hermann-Gerland Kampfbahn |
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| 15.03.2008 | Regionalliga Süd | Stuttgarter Kickers - FC Bayern (A) | 0:1 | 3.100 | GAZI-Stadion |
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| 07.03.2008 | Regionalliga Süd | FC Bayern (A) - SpVgg Unterhaching | 2:4 | 1.275 | Hermann-Gerland Kampfbahn |
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| 02.03.2008 | Regionalliga Süd | FSV Frankfurt - FC Bayern (A) | 2:2 | 2.200 | Volksbank Stadion |
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| 23.02.2008 | Testspiel | FC Memmingen - FC Bayern (A) | 0:1 | 720 | Memminger Arena |
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| 09.02.2008 | Testspiel | Tennis Borussia Berlin - FC Bayern (A) | 0:1 | 300 | Mommsenstadion |
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| 08.02.2008 | Testspiel | Union Berlin - FC Bayern (A) | 4:1 | 2.012 | Alte Försterei |
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| 03.02.2008 | Testspiel | Red Bull Salzburg (A) - FC Bayern (A) | 1:2 | 300 | EM-Stadion Salzburg |
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| 19.01.2008 | Testspiel | TuRa Rüdinghausen - FC Bayern (A) | 1:5 | ca.250 | Witten/Rüdinghausen |
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| 17.01.2008 | Testspiel | SV Lippstadt - FC Bayern (A) | 1:0 | ca.500 | Am Waldschlösschen |
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| 15.01.2008 | Testspiel | SW Marienfeld - FC Bayern (A) | 0:5 | 200 | Sportplatz Marienfeld |
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| 13.01.2008 | Hallenturnier Amateure | 21.Ibbenbürener Hallenfussball-Festival | 2.Platz | 1.000 | Sporthalle Ibbenbüren |
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| 12.01.2008 | Hallenturnier Amateure | 12. Veltins-Hallen-Masters | 1.Platz | 650 | Dünnefeldhalle Meschede |
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